O objetivo do curso de Doutorado é formar pesquisadores, qualificando-os a liderar projetos de Pesquisa e Desenvolvimento (P&D) na indústria, na universidade ou em instituto de pesquisa. São requeridos 48 créditos (podendo ser computados se obtidos em curso de mestrado), sendo que duas disciplinas deverão ser cursadas obrigatoriamente na Formação Fundamental e, uma, na Formação Básica Específica. O restante das disciplinas será definido de acordo com as necessidades de cada candidato. O aluno deverá, ainda, ser aprovado no exame de proficiência em duas línguas estrangeiras, na modalidade de leitura de texto que aborde temas científicos e tecnológicos, bem como no Exame de Qualificaçãao (escrito e oral) e na defesa da tese de doutorado.

O candidato deve realizar a parte escrita do exame de qualificação até o final do seu terceiro semestre letivo, contado a partir de sua matrícula no programa, e a parte oral até o final do seu quinto semestre.